2011年Arumugam等．描述人类肠道菌群组成的特征模式首次在不同的国家和文化中被保存下来。这些模式被称为肠型，是由以下三种细菌属中的一种显著高丰度所定义的:拟杆菌(菌群1)却能合成更多形成,普氏菌(菌群2却能合成更多形成)瘤胃球菌属(菌群3)却能合成更多形成。

这个简单的肠型概念从此将微生物界划分开来。一些研究人员发现自己受到了离散菌群类型这一诱人想法的影响，而另一些人则断然拒绝了这一想法，认为它过于简单，模糊了我们肠道菌群的更准确、持续的图像。然而，在这个阶段，要一劳永逸地决定谁是对的，谁是错的，似乎还为时过早。在“肠道型”和“渐进型”之间的争论中，最好不要忘记最初的肠道型研究中最重要的方面:这表明我们的肠道微生物群不仅在个体层面上有差异，而且在全球范围内也有差异，这些差异可能有更深层次的生物学和潜在的临床意义。

在一个今天发表的文章在基因组生物学， Jeroen Raes从他是作者的那篇原始的肠型文章继续下去，试图回答另一个迫切的问题:如果人类肠道微生物群呈现出全球性的组成差异，那么同样的情况也会发生在其他生物体中吗?如果答案是肯定的，那么它对模型动物研究有什么影响呢?

在这项研究中，作者观察了五种流行的实验室老鼠品种。他们发现了两种与人类肠道菌群1和3极为相似的微生物群。除了任何有自尊心的微生物组研究人员的武器库里的标准武器——粪便测序，Raes和同事们还测量了炎症性肠病标志物——的水平calprotectin-在老鼠的粪便里。这是他们最令人震惊的观察结果之一:他们发现他们所定义的小鼠肠型2与钙保护素水平的增加显著相关。

换句话说，Raes和同事们表明，小鼠的肠道类型可能是炎症性肠病的驱动因素或表现。这些结果的含义，哪来的更专注基因组生物学读者会想起我们最近的Huttenhower和同事发表了有关炎症性肠病肠道失调的文章美国正以任何一种方式引人注目。