2019冠状病毒病全球大流行及其巨大的社会和经济影响，引起人们对高致病性人类冠状病毒的高度关注。冠状病毒可以感染哺乳动物和鸟类，包括牲畜和伴侣动物。因此，它们不仅是对公共卫生的挑战，也是对兽医和经济影响的担忧。
在过去20年里，冠状病毒引起的另外两场流行病包括分别于2003年和2012年发现的严重急性呼吸综合征(SARS)和中东呼吸综合征(MERS)。虽然以前的流行病提高了人们对需要临床治疗或预防性干预的认识，但迄今为止没有有效的治疗方法。
中东呼吸综合征是沙特阿拉伯首次发现的一种呼吸道传染病，由对人类具有高致病性的中东呼吸综合征冠状病毒(MERS- cov)引起，据世界卫生组织统计，病死率约为35%世界卫生组织(世卫组织)。感染中东呼吸综合征冠状病毒的个人可能没有、轻微或严重的呼吸道疾病，甚至死亡。这使得很难将这种病毒与其他类似的呼吸道疾病区分开来。
MERS从中东主要流行地区逐渐扩散到四大洲的27个国家。绝大多数MERS病例是沙特阿拉伯报告的，其次是韩国。由于缺乏有效的治疗和预防策略，来自中东和中东的频繁旅行者已经引起了对一场全球大流行的担忧。早在2018年2月，世卫组织正式将中东呼吸综合征冠状病毒纳入研发蓝图促进这一领域的研究。
自2005年以来，没有任何地方报告过人类感染SARS的病例。相比之下，大量连续的中东呼吸综合征病例和聚集性感染已经报道自2012年9月起由世卫组织提供。在严重急性呼吸综合征冠状病毒2 (SARS-CoV-2)大流行期间，人们自然会提出一个重要的问题:MERS-CoV和SARS-CoV-2之间是否会发生重组?
理论上，不能完全排除两种冠状病毒合并感染同一宿主的可能性，因为它们的宿主物种是重叠的，比如人类和蝙蝠。一个最近的研究建议两种病毒之间的重组实际上是可能的，并敦促实验室发展诊断能力，以便在中东等高危地区的患者样本中检测重组冠状病毒。此外，还需要密切监测中东呼吸综合征冠状病毒的一些进化特征，如哪些基因受到正向选择的影响。
目前，大量研究集中在SARS-CoV-2上。我们认为，了解中东呼吸综合征冠状病毒的流行病学特征和进化史也至关重要，因为这两种冠状病毒具有遗传相关性。
在我的团队的支持下，我们花了大量时间和精力收集截至2020年6月1日的所有MERS确诊病例和相关信息的综合数据。在此基础上，我们收集了三个数据集:
- 全球个人人间病例清单，包括人口学、接触和临床信息，
- 生态地理和社会经济特征在中东适当的行政级别，和
- 全球mers冠状病毒全基因组序列。
基于这些数据集，我们深入分析了中东呼吸综合征疫区的流行病学和MERS冠状病毒的系统进化。这提供了关于这种病原体的人口和分子流行病学的情况，确定了需要进行公共卫生监测和干预的高危人群和地区，以控制地方性病原体并防止潜在的大流行。
我们绘制了全球人类MERS病例分布和传播类型。我们发现人畜共患病只发生在中东，尽管与动物接触的病例也被输入到欧洲和东南亚。我们的分析显示，≥65岁或有潜在疾病的患者死亡风险显著更高，并首次发现动物接触对死亡风险的影响取决于年龄和性别。
的时空的地图自2012年9月在沙特中西部比沙首次报道以来，中东呼吸综合征向东部(阿拉伯联合酋长国和阿曼)的传播速度高于向其他方向的传播速度。近年来，这种扩散似乎正在加速。系统地理分析表明，主要进化枝的时空传播模式主要表现为中东地区的局部迁移和偶然的远距离输出。
我们迫切建议，应通过积极监测动物和人类宿主来密切监测病毒突变。虽然SARS-CoV-2疫苗的快速开发为如何推进MERS-CoV候选疫苗的开发提供了启示，但应提前规划非药物干预措施和动物疫苗，从源头上推迟或阻止MERS-CoV的适应。
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