化学信息学杂志

引用构成了学术出版界许多指标的基础。尽管它们通常被视为科学影响的标志,但实际上,引用论文的原因是多种多样的。Egon Willighagen概述了一名飞行员化学信息学杂志旨在构建更多信息信息参考引用。

高引文数被广泛看作是影响的指示。但是,我们经常不知道为什么引用了一篇文章。

虽然在迄今为止大多数引文都具有支持是相当合理的,但有时文章因引起争议而被引用。

但是,并不是每个积极的引用都相同。

有时您会引用一篇文章,因为您使用了该文章中解释的方法,有时您会引用一篇文章,您对此没有强烈的看法,但是因为您觉得有义务这样做,只是因为论文是权威的。

在2012年,佩罗尼(Perroni)和塞(Perroni)解决了这个限制通过开发目前的引用实践引用分型本体论(Cito)。

他们创建了引用意图类别,可以用作参考列表中的注释或文本中的内联引用。

例如,如果作者在论文中使用了一种方法,则可以添加注释CITO:使用甲氨酸在他们的参考列表中表明。

也许作者对论文的调查结果提出异议,在这种情况下,他们可能会注释他们的参考CITO:不同意

但是提出解决方案与解决问题不同。不幸的是,对这些想法的吸收受到限制。

Citeulike参考经理有支持,此服务自从退役以来。

因此,化学信息学杂志提出了一个提议飞行员A工作流程启用CITO注释在我们的日记中使用(另请参见这些作者指南)。

目的是测试作者的吸收,并确定在实践中如何起作用。

为了使事情变得简单,我们提出了我们建议作者使用的CITO注释子集(作者可以使用任何CITO注释)。

虽然内联注释是优先的,但我们认识到这将更加复杂,因此我们决定仅从注释参考列表开始。

吸收

自飞行员开始以来,另外一份社论和六篇期刊文章采用了这种方法。

一些作者增加了比我们预期的更多的引用意图,使用的CITO注释的多样性也比飞行员建议的要高得多。

我们一直在开发下游工具以使用和进一步分发信息。

其中之一是组合WikidataScholia哪些存储和可视化关注和PubMed引文数据。

我们用Cito注释注释了引用,并统计页面显示在6月13日,在Wikidata中发现了Cito注释的结果,该注释在24种不同的期刊上分发了56篇文章。

化学信息学杂志只是一个可能的来源,而是唯一的日记。键入的引用指出了100多种不同的期刊中的250多种文章。

到目前为止,已有370多种类型的注释已有300多种引用(可能有多种引用文章的意图)。使用此下游工具,我们可以跟踪吸收:

但是各种Scholia页面使我们能够更详细地探索结果。例如,它向我们表明,在2020年使用了九种不同的引用意图化学信息学杂志文章,可见这个Scholia人物

当前限制和下一步

当前的方法有些限制。在试点文章中,将CITO标签嵌入了参考列表中的注释。

这种方法的缺点是,如果文章不止一次引用文章,您将失去打字和单个引用之间的联系。

我们希望能够提供内联Cito注释,但这需要仔细考虑并进一步发展工作流程。

另一个问题是,添加CITO标签是作者的手动过程,因为参考书目程序目前不支持其使用。

为了使作家的生活更轻松,并遵循2021年春季的Twitter讨论,我们开发了一个具有本机CITO支持的降价模板。在这里,作者在引用文章时仅表示CITO类型。

然后,手稿可以轻松保存为Word文件,以使提交给日记帐。这化学信息学杂志模板是从我们的GitHub存储库中获得,作者和编辑应该随意适应自己的日记需求。

今年夏天,我们希望通过rstudio

一个更容易解决的限制是引文分型数据的提取和传播的自动化。

目前,这仍然是手动完成的,显然规模不佳。这也是为什么我们花时间从飞行员开始缓慢启动并监视遇到的问题的原因。

但是我们现在非常有信心,这种方法已经为下一阶段做好了准备,我们欢迎其他期刊也开始考虑采用飞行员。

在技​​术层面上,我们将开发源代码,可以从BMC文章的XML源(JATS格式)中提取CITO键入信息,并自动将此信息自动化到Wikidata中。

结论

飞行员的进度非常令人满意,我们有信心化学信息学杂志准备将这一长期的愿望从科学界带到现代出版。

该飞行员已成为概念验证,并证明社区中有兴趣将其作为标准化。到目前为止,吸收水平很低,但是我们对它的运行方式感到满意。

我们知道,需要解决一些局限性以进一步发展这一想法,并以平滑和非破坏性的方式更广泛地将其推出。

进一步的引用想法取决于期刊编辑,作者,出版商和索引服务的综合意愿。

我们欢迎进一步参与CITO策略,我们很乐意就我们在飞行飞行员方面的经验提供建议。

强烈鼓励期刊编辑联系化学信息学杂志关于加入飞行员。

致谢化学信息学杂志编辑们对这篇文章的宝贵反馈。

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注释