454个测序的条形码库

在最近发表的论文中基因组生物学,,,,罗伯特·尼科尔(Robert Nicol)和来自广泛研究所在马萨诸塞州,报告一种新方法,用于减少与454个测序相关的时间和成本。

下一代测序技术的最新革命对基因组学领域产生了重大影响,大大降低了测序大基因组的成本,例如哺乳动物的基因组 - 最近出版的巨型熊猫基因组是使用Illumina简短阅读序列数据完全测序的。但是,对于中小型基因组而言,这种降低的成本降低不太明显,在该基因组上运行单车道或频道会导致序列数据的大量过度覆盖,从而降低了该过程的成本效益。此外,在测序之前手动准备DNA库是劳动密集型且耗时的,还引入了研究人员错误的可能性,所有这些都会增加整体成本。

新的描述了一系列用于样品制备的方法的优化,并引入了一种新技术,用于在DNA片段的开始中添加简短的“条形码”序列。这允许每个DNA库被唯一地识别,这意味着可以将多个库混合在一起并在同一序列器通道上运行,从而使测序几个较小基因组的成本在预算较小的实验室范围内。这些新技术应导致测序新基因组的速率进一步提高。

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