促进标准化基因组注释

更快,更可靠的基因组测序意味着可用的个人基因组序列的数量正在迅速增加,但是由于缺乏标准文件格式,对个人人类基因组序列的分析受到阻碍,无法促进比较分析。在本月发行基因组生物学,Karen Eilbeck及其同事在GVF中提出基因组变异格式。GVF是已经广泛使用的GFF3标准的扩展,用于描述基因组注释。GVF的效用是通过对前10种公共可用人类基因组的分析来证明的。作者称此数据集为“ 10GEN”,并希望这将成为促进未来个人基因组分析的标准参考。

GVF和10GEN数据集可用https://www.sequenceontology.org/gvf.html并在发表的文章中包括在基因组生物学网站这里

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