人类基因组中发现的序列周期

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在A.文章刚刚发表基因组生物学,查尔斯哈伯特和Hugues Roest Crollius.在巴黎的Ecole NormaleSupérieure中表明存在对人类基因组中的核苷酸频率的新周期性,这可能对核心和基因调控的定位有影响。

在他们的研究中,Hebert和Roest Crollius相对于转录起始位点对齐人类基因,并观察Yy二核苷酸的图案(其中Y是C或T)间隔的10个碱基对与转录起始位点分开。重要的是,核小体定位数据的分析表明核体与二核苷酸有关。该图案富含基因,具有EP300核体建模蛋白的结合位点。作者推测,重复模式可以有助于使核体定位,使得它们通过EP300容易地修饰,因此通过RNA聚合酶促进其位移,尽管该模型目前是投机性的,并且将在未来的工作中需要确认。

然而,这项工作在人类基因组中提出了一种令人兴奋的新模式,并对定位的核体如何影响基因的转录有影响。

核小体旋转设置与组织特异性人类基因的启动子转录调节有关

Charles Hebert和Hugues Roest Crollius,Genome Biology 2010,11:R51

https://genomebiology.com/2010/11/5/r51

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2评论

博士。枪

归因于Lars Juhl Jensen:

正如我理解论文,新发现应该是当您在TSS +1站点对齐启动者时看到此信号。但据我所知,ioshikhes等。在1999年发现了类似的东西。

进一步挖掘一点:mavrich等。在2008年显示,核体以相对于转录起始位点以非常规则的方式定位(DOI:10.1101 / GR.078261.108)。结合Satchwell等人发现的10BP周期。1986年似乎似乎相对于转录开始似乎普遍导致观察到的10BP周期。

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