以眼还眼,蝾螈还蝾螈:组织再生的基因组学

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GB的标志在人类优先考虑的事项中,组织再生几乎排在首位;一起拥有永恒的青春和不朽。而且,在传说和神话中,英雄和坏人——但最常见的是怪物——都拥有让失去的器官和四肢再生的惊人能力。

不过,神话也有一定的道理。在2011年,基因组生物学发表了一篇文章描述扁平涡虫再生头的转录组Schmidtea mediterranea。2012年初,我们又发表了一篇文章试图揭示错综复杂的监管机制管理扁形虫再生。

幸运的是,我们不需要在进化过程中寻找有组织再生能力的物种。更复杂的生物可以在我们的花园附近找到:蝾螈和蝾螈是与人类最接近的动物,它们有内在的能力让身体的一部分生长回来;因此,它们为研究组织再生提供了一个极好的模型,特别是在临床应用方面。但这些模型存在问题,因为它们的基因组太大,现有技术无法对其进行测序。

红斑蝾螈中

在2月份的基因组生物学德国马克斯普朗克心肺研究所的托马斯·布劳恩和他的同事描述蝾螈健康和再生组织的转录组Notophthalmus viridescens.研究人员收集了大量蝾螈测序和蛋白质组学数据,可供其他研究人员参考在newt-omics数据库中(预计今年春天会有一个新的、更具互动性的版本)。蛋白质组学增强的转录组测序方法使尿路基因得以表征,同时避免了这些生物基因组测序的相关问题。

这项研究并不局限于转录组的特性——Braun和他的同事还鉴定了几百种特异于尿路的蛋白质;有趣的是,其中一些属于新的蛋白质家族。他们预测,这些数据可以而且应该成为未来蝾螈组织再生机制研究的一个极好的基础。我们还能说什么呢?去组织再生吧!

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