碳水化合物活性酶主要存在于白腐菌、褐腐菌和植物病原真菌中。这些微生物降解含有木质素、半纤维素、纤维素、多糖和果胶的植物细胞壁复合基质。自1998年以来,CAZy数据库精心整理了五个碳水化合物活性酶家族的数据:糖苷水解酶(GH),糖基转移酶(GT),多糖裂解酶(PL),碳水化合物酯酶(CE),carbohydrate-binding模块(CBM)。

最近发现CBM和GH酶家族的一些成员具有相同的作用模式，如lytic多糖单加氧酶(LPMO)，这使得CAZy的管理人员对数据库进行了重大更新。发表于对生物燃料的生物技术，Levasseur和他的同事们还需要注意的是，酶需要协同作用，以打破植物细胞壁的相互连接的成分。考虑到这一点，他们创造了一种新的酶辅助活动(AAs)包括LPMOs，以及被认为协同作用的氧化还原木质素降解酶家族。

根据蛋白质序列的相似性，将辅助酶分为10科，具有“辅助酶”的功能，提高了其他种类酶降解植物细胞壁组分的途径。从文献中推断酶家族的生化和三维结构信息，每个家族至少有一个生物化学特征的创始成员。

对41个真菌基因组中鉴定出的1576种AA酶进行了酶库的比较基因组分析。值得注意的是，在木霉属reesi这种真菌被广泛应用于工业生产用于碳水化合物转化的酶。与真菌相比，细菌降解酶的研究较少，作者认为，在反刍动物肠道菌群和土壤中发现的木质素降解细菌将是未来研究的一个途径。