许多肠道原生动物都是在各种动物中发现的危险寄生虫。其中之一Entamoeba Hystolictica,引起人类的结肠炎和痢疾,并影响整个地球上十亿人。然而,尽管其基因组已经在大约十年前进行了测序(请参阅本文在自然在2005年),我们仍然不了解这种寄生虫一生中最重要的方面。
Entamoeba的生命周期包括两个阶段:它在第一个阶段在宿主内部增殖,而另一个则变成了非分散的多核囊肿。囊肿的形成对于Entamoeba的生存,但是由于缺乏正确的工具,我们无法在这个重要的人类寄生虫中研究的过程:我们根本没有诱导综合和脱口机的方法E. Hystoltica体外文化。
进入Entamoeba入侵:等效的寄生虫影响爬行动物。它的一种菌株IP-1,最初是从漆成乌龟中隔离的(狂热的基因组生物学现在应该提醒读者今年早些时候发表的一篇文章描述了仅此爬行动物的基因组),能够在轴原培养物中形成囊肿和研究该过程的方法体外已经开发了。但是,仍然缺少一件事,阻碍了更好地理解这一过程的努力:这就是E.Invadens基因组。
在文章中今天发表在基因组生物学,尼尔·霍尔(Neil Hall)和同事通过描述E.Invadens基因组组装。他们发现该物种的核心基因含量与其近亲非常相似,E.羟基溶食。此外,他们还考虑了百科全和脱衣舞过程中的转录组变化。他们发现,在百确定期间具有增加表达的基因编码磷酸脂肪酶D,这是一种参与脂质第二信号信号传导的酶。使用活性和抑制测定,HALL及其同事能够确认磷脂酶D在百确定过程中的作用。
当然,磷脂酶D只是一个起点。现在,这些基因组资源可用于许多肠道寄生虫,我们应该期望的是,比较研究肯定会遵循基因组和转录组序列的比较研究。而且,E.入侵功能研究也许可以转化为发现治疗人寄生虫原生动物的治疗靶标。
[…] - Neil Hall及其同事描述了Entamoeba Invadens的基因组和转录组 - 令人讨厌的E. Hystolictica的近亲和用于广播研究的模型生物。您可以在我们的其他博客文章中阅读有关这项研究的更多信息;[…]