随着人类基因组序列的完成，对其的深入分析开始了encYCLOPEDIAoFdNAe牛肉（编码）项目 - 旨在确定人类基因组中的所有功能元素。

该项目涉及一个全球研究小组的联盟，可以通过公共数据库访问新兴数据。生物中央有发表了早期发现的选择。

编码计划导致MODENCODE一个渴望识别模型生物基因组中功能元素的项目秀丽隐杆线虫（线虫）和果蝇Melanogaster（果蝇）。将“编码方法”扩展到其他模型生物可以进一步对来自人类基因组项目的发现的进一步生物学验证。

并且在编码上的构建不止于此……

尽管编码项目的某些特定发现已经批评，像编码一样的注释变得越来越被接受，以推进模型生物的研究。

结果，Denis Tagu，John Colbourne和NicolasNègre文章今天发表在BMC基因组学，认为该过程的下一步是了解遗传系统如何在生活生态系统的自然背景下做出反应。

他们将这种方法称为“新词模”，即应用于新兴和非模型生物的基因组的功能注释，这些生物通常不适合大规模前向遗传学。

但是，与编码和Modencode的组织结构不同，Tagu及其同事建议Neoencode应该采用一种集成方法将所涉及的社区的要求拼凑在一起。

这不是一个由协调集团领导的新财团的建议，而是针对各个社区内部采用，组织和适应其研究的几项“自下而上”计划。“共同线程”是共享的路线图和各个Neoencode社区之间的交流，以增强单个项目。

开放

提交给BMC基因组学，作者热衷于在社区内部讨论他们的建议。为了促进这一点，他们要求完全打开同行评审过程，以便读者可以访问审阅者的原始评论。

因此，以前所未有的举动BMC基因组学（通常是在封闭的同行评审）（该期刊）在通讯部分末尾发表了在手稿的早期版本上收到的评论。

这样一来，同行评审者本身就开始了有关新词模的对话，读者可以听到各种视图：

“这是一篇有趣的观点，建议我们对非模型生物的基因组学方法进行'缩减'，并提出与当前研究的生物相比，对更广泛的生物的理解，以提供“系统生物学”水平的编码程序。”马克·布莱克斯特

“提出对其他基因组进行更完整的注释是一个有趣的想法，值得公开辩论。”布莱恩·奥利弗（Brian Oliver）

“关于这种观点，有很多事情对我不好。首先，我是典型的特立独行的科学家。我经营一个小实验室，喜欢提出自己的问题并设计自己的方法。”吉姆·马登（Jim Marden）

我们的在线杂志，生物群落，也出版了面试杰弗里·布尔（Jeffrey Boore）探索了对新词牌项目的需求，以及如何帮助现有基因组项目。

如果您想继续对话，我们期待收到您的评论！或加入Twitter #NeoEncode上的辩论。

伊丽莎白·莫伊兰（Elizabeth Moylan）和凯瑟琳·赖斯（Catherine Rice），BMC编辑。