表观脑时钟老化的生物标志物

基因组生物学最近发表了两篇文章,都在寻找潜在的衰老生物标志物。在这里,基因组生物学副主编姚宜欣讨论了这两项研究,并给出了表观遗传时钟的概述。

我们用时钟来记录时间。当提到“时钟”这个词时,我想到的是我梳妆台上的沙漏,我客厅里的钟摆,我梦寐以求的第一块手表,以及我智能手机上的显示屏。我们用时钟反复测量持续时间,包括我们的寿命,也就是我们的“年龄”。

最着名的表观遗传时钟之一是Horvath时钟

然而,一些研究老龄化的研究人员对传统时钟不满意;相反,他们使用“表观脑时钟”进行组织的时间年龄。这些时钟由数百个DNA甲基化位点组成 - 在基因组中化学改性DNA的位点。

该思想是甲基化的变化以大致恒定的速率随机发生,使得甲基化的变化程度反映了组织的年龄。最着名的表观遗传时钟之一是Horvath时钟,这激发了许多好奇的思想,以进一步看待表述表观衰老。

来自南安普敦大学的一支球队最近发现了一种建立一个表观遗传时钟来测量时间衰老的新方法。年龄是多种慢性疾病的危险因素。以前的研究施加了缔合物映射,也称为联动不平衡映射,以基因组关联研究(GWAS)的形式为期慢性疾病,以了解人类遗传易感性。

从GWAS目录,Christopher Bell及其同事中建立了与GWAS目录,Christopher Bell及其在整个基因组中的DNA甲基化)从超过两千人分析,使用称为甲基化DNA免疫沉淀序列测序或MEDIP-SEQ的方法,以识别广泛的区域变化超过年龄。这种方法允许它们将表观遗传时钟与疾病联系并将表观遗传变化与疾病模型的年龄联系在一起。

该时钟与Horvath时钟不同,使用DNA甲基化块代替单个位点。它由这些嵌段的71组成,其被称为年龄相关的差异甲基化区域(ADMR)。之前的时钟已经看过数百个DNA甲基化位点,但这里,一个DMR可以覆盖多个位点。为了证明设计成功,该团队发现这些构建块具有强大的遗传关联,患有年龄相关的骨质损失等常见疾病。这项工作是最近发表基因组生物学

DNA甲基化随着年龄的年龄变得更加变化

虽然我们可能有几个时钟来跟踪我们组织的时间顺序,但人们似乎以不同的速度为年龄。我们如何衡量这个“生物老化”?众所周知,随着我们的年龄,DNA甲基化变得更加可变;换句话说,我们在与我们的DNA中的特定位置缀合的甲基术语方面表现出更多的变化。然而,到目前为止,甲基化水平的差异而不是甲基化的变异,而且迄今为止最受关注。

新研究发表基因组生物学看着在老化过程中变得更加变化的甲基化位点,发现这些网站可以更好地反映生物老化。由BAS Heijmans博士领导的团队鉴定的甲基化的位置也被发现与发育或神经发育基因共同。

这些位点似乎与我们年龄增长时发生的RNA表达的变化相关,并且已知受影响的途径与老化过程有关,包括代谢和DNA损伤修复。通常在晚期人的人中发现的肿瘤也积累了团队所识别的确切网站的DNA甲基化变化。

这两项研究都在努力寻找衰老的潜在生物标志物,这应该会加速衰老在老年疾病中的作用的机制发现。未来的工作是确定标记健康状况和预测死亡率的甲基化概况,这将更加令人兴奋。

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