BMC系列的亮点- 2021年9月

环境DNA检测到受威胁和难以捉摸的鲨鱼和鳐鱼物种- COVID-19大流行对伦敦急诊就诊的影响,英国-使用冷冻细胞绘制dna -蛋白质相互作用的CUT&RUN工作流程-代谢综合征患者咳嗽敏感性相关的危险因素-对头痛疾病的补充和替代药物的系统综述。

BMC生态和进化-透过沉淀物水域观察:环境DNA减少了混浊海洋栖息地中鲨鱼和鳐鱼的幻影多样性

©亚丁湾Ip

海水的沉积,加上难以捉摸的行为,使得生态学家很难监测受威胁或难以捉摸的物种。然而,随着新的分子技术的发展,研究人员可以通过在环境样本中发现的DNA发现比眼睛看到的更多的东西。

最近发表的一项研究生态与进化, Ip和他的同事将环境DNA (eDNA)技术应用于海水,在新加坡附近城市珊瑚礁的沉淀物环境中检测鲨鱼和鳐的种类。历史报告记录的鲨鱼和鳐鱼物种的多样性比最近看到的要高得多。因此,研究人员询问当地物种是否已经灭绝,或者它们是否已经变得过于稀少,无法用传统的视觉调查方法检测到。利用海水中的eDNA,研究人员发现生活在新加坡海岸的鲨鱼和鳐的数量是过去20年里通常发现的两倍,他们对发现两种可能的新物种感到兴奋。

面对全球变化,更多地了解地球过去和现在的生态系统,对管理生物多样性丧失和确定保护优先次序比以往任何时候都更为重要。这项研究是一个很好的例子,说明环境DNA技术的进步如何帮助我们满足对知识的需求。要了解更多关于eDNA技术的承诺,请访问BMC生态与进化关于该主题的新文章集合,欢迎提交<https://www.biomedcentral.com/collections/aedre>.

BMC卫生服务研究:COVID-19大流行对伦敦两家大型医院急诊科就诊模式的影响:一项观察性研究

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英国各地的医院2019冠状病毒疾病流行的原因是为了应对日益增长的需求。首先,英国国家卫生局对资源进行了前所未有的重新安排,包括推迟非紧急程序和提供视频咨询。2020年3月,英国政府引入了一系列干预措施,如社会疏远和指示人们在国家封锁下呆在家里。

然而,这些为应对COVID-19大流行而采取的措施对英国急诊(ED)就诊的影响相对未知,尤其是对非COVID-19相关急诊。因此,Vollmer和他的同事在伦敦帝国学院医疗保健NHS信托(ICHNT)进行了一项关于急诊科就诊的观察性研究,以解决对知识的需求。

在英国政府于2020年3月12日至2020年5月31日实施了第一次全国性禁闭后,ICHT的教育入学率下降了35%,反映了整个英格兰的更广泛趋势。入学人数的下降主要是那些65岁以下以自己的方式到达的人。E2019冠状病毒疾病患者在2020年3月12日后的ED随访减少48%,住院患者的预后无明显变化。与寻求其他紧急医疗服务的人相比,这些发现在多大程度上与因担心冠状病毒而产生的回避行为有关,目前尚不清楚。

BMC研究指出:ssvQC:组蛋白修饰和转录因子的集成CUT&RUN质量控制流程

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你体内的所有细胞都含有相同的DNA,但每一种细胞的表现都不一样。蛋白质,包括转录因子和组蛋白,通过与DNA结合来调节基因表达来决定细胞的特性。控制基因活性的dna -蛋白质结合的变化是发育和疾病的基础。因此,研究特定的dna -蛋白质相互作用是非常重要的。

传统上,一种叫做染色质免疫沉淀(ChIP)的技术被用来实现这一目标。然而,ChIP存在一些缺陷,这促使Skene和Henikoff开发了一种新的技术,名为CUT&RUN (Cleavage Under Targets and Release Using Nuclease)。

在CUT&RUN中,靶向dna -蛋白复合物是直接从细胞核中分离出来的,而不是遵循沉淀步骤。在ChIP中,要执行CUT&RUN,需要使用一种特定的抗体来识别感兴趣的dna结合蛋白。然而,在cut & run中,一种识别蛋白质-抗体相互作用的酶被用来切割不同的蛋白质- dna复合物,可以被分离和测序。因此,与ChIP相比,使用更少的细胞,CUT&RUN允许以更高的分辨率绘制dna -蛋白质相互作用的基因组图。

由于技术上的困难,在新鲜细胞上使用切割-运行技术并不总是可行的。因此,在BMC研究笔记中,Boyd和同事评估了这种新方法如何使用冷冻细胞。Boyd和同事比较了新鲜和冷冻样品切割和运行的工作流程,并提出了一个名为ssvQC的R包,用于质量控制和比较从该技术中获得的数据质量。研究人员发现,冷冻样本是对组蛋白标记(H3K4me3)和转录因子(Ikaros)进行切割和运行的良好起点。

BMC肺药:代谢综合征患者的咳嗽过敏反应:临床发现及其可能的机制

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咳嗽过敏症的特征是由低水平的热、机械或化学暴露引起的令人头痛的咳嗽。多年来,没有一个术语来描述这种没有明显临床解释的咳嗽,但这种情况现在被命名为咳嗽过敏综合征,给了患者一个令人放心和常见的诊断。需要更好地了解咳嗽超敏反应的危险因素和病理生理机制,以确定新的靶点来控制病情。

在这篇相关论文中,Cheng等人研究了辣椒素引起的咳嗽——辣椒素是一种来自辣椒的化学刺激物。研究人员将患有代谢综合征的患者与健康对照组进行了比较。代谢综合征是对患有糖尿病、高血压和肥胖的患者的医学术语。有趣的是,与对照组相比,患有代谢综合症的参与者对辣椒素引起的咳嗽更敏感。研究者进一步证实代谢综合征患者辣椒素诱发咳嗽敏感性增高与睡眠呼吸暂停、胃食管反流密切相关,推测气道炎症可能在辣椒素诱发咳嗽敏感性增高的发病机制中发挥作用。

BMC补充医学和治疗-头痛和偏头痛临床实践指南:补充和替代医学建议的系统回顾和评估

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包括偏头痛在内的头痛是全世界最常见的疾病之一。根据世界卫生组织(who)的数据,近一半的成年人在过去一年中至少经历过一次头痛。据报道,许多补充和替代药物(CAMs)有助于治疗和管理头痛疾病,但它们实际上有临床有益的效果吗?

在BMC补充医学和治疗中,研究人员根据临床实践指南(CPGs)调查了头痛疾病中CAMs的数量和质量。cpg描述了用于帮助医生决定如何照顾有特殊情况的人的陈述。Ng和Hanna搜索了2009年至2020年发表的文献,以确定用于治疗和管理头痛和偏头痛的cpg。

在描述头痛疾病术语的486个独特搜索结果中,21个包含cpg的搜索结果符合条件并进行了质量评估。15个cpg提到了CAM,其中13个cpg提出了CAM建议。这些发现可以帮助改善患者和医疗保健专业人员之间的对话,使用CAM治疗/管理头痛和偏头痛。

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