探索基因组暗物质

一篇社论关于“暗物质”RNA的作用和丰度的辩论,BMC生物学得出的结论是,在我们对非编码rna的作用做出更全面的判断之前,我们需要对其功能有更多的了解。

到目前为止我们对ncRNA的功能了解多少?相当多,但只有少数。已知的功能性ncrna,以及它们可能发挥作用的方法的多样性,在Chris Ponting的书中有很好的介绍2009年回顾.但是那些我们已经知道功能和机制的暗物质rna的数量远远超过那些我们不知道的,到目前为止,只有不到100个已经被很好地描述了。还有更多有趣的相关性已经被发现——例如长ncrna和某些癌症之间的相关性(在最近的一次分子癌症审查)——但当然,相关性并不等于因果关系,而且其中许多还缺乏明确的功能或拟议的机制。

一个疟疾的最新研究这个月在BMC生物学提供了一个诱人的例子。作者检测了存在于致病性人血期的长ncrna,进一步的研究表明,这些长ncrna与人血期的启动子具有一定的序列相似性var基因——这些基因编码一个毒性因子家族,这些因子定期改变表达以避免人类免疫反应,其调控目前还不清楚。但是,虽然这是一个有启发性和有趣的观察,我们并不知道这些ncrna可能的作用机制,尽管这没有抑制猜测这篇文章本身以及随之而来的BMC生物学评论.现在的挑战将是将基因组观察转化为生化观察。

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