Tef基因组:破译埃塞俄比亚的一种关键作物

对农业上重要的禾本科植物如玉米玉米),高粱高粱二色的),使我们对这些植物的进化和非生物胁迫反应有了重要的认识。

微软目前
微软目前。图片由Rasbak在维基百科提供

近年来出现了一种增加的关注将这些进展应用于更本地化的作物,这些作物通常是低收入国家的重要营养资源。在埃塞俄比亚Eragrostis微软(Tef)是一种原产于埃塞俄比亚和厄立特里亚高原的草,是一种主要作物,约占世界粮食总产量的四分之一谷物产量

Tef拥有许多地产,这使得它对埃塞俄比亚的农民很有吸引力。这种作物在干旱和涝渍地区都长得很好,相对来说营养丰富。此外,由于其营养状况以及麸质不耐症患者可以食用它,它有可能在国际上变得更受欢迎乳糜泻).近年来出现了一种数量的计划提高这种作物的产量,尽管它很受欢迎,但产量仍然很低。

定序器
HiSeq 2000音序器。图片由RE73在维基百科提供

微软目前基因组BMC基因组学为这种植物的生物学提供了新的见解,也为社区提供了宝贵的资源。

这个来自埃塞俄比亚、瑞士和美国的国际研究团队将他们的分析重点放在了这种植物生物学的几个方面。如上所述,Tef在埃塞俄比亚是一种有吸引力的作物,因为它相对抗旱。然而,当供水有限时,作物产量就会下降,因此了解铁矾对非生物胁迫的响应是提高产量的关键。在其他植物中,如水稻和高粱,也有许多基因在这种非生物胁迫反应中发挥作用,所有这些基因的全部或部分拷贝都在Tef基因组中被发现。

研究人员对SAL1的存在特别感兴趣,因为该基因的下调或灭活副本之前已经被证明可以提高植物的抗旱性拟南芥小麦.在其他草类中,SAL1通常有1-2个拷贝,但Tef基因组显示了7个拷贝或部分拷贝,这是基因复制的结果,代表了未来研究的目标。

高地
埃塞俄比亚高原。图片由Andro96在维基百科提供。

此外,基因组分析证实了与谷蛋白不耐症有关的表位的缺失,并提供了确认以前的工作他们使用抗体来分析这个。

希望在这个项目中产生的数据将在未来几年有用,并将有助于研究提高作物产量的最佳方法。Tef接管从这里开始!

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